南京农业大学食品科技学院科研机构根据2020年3月学院官网显示，学院有国家级科研机构5个，省部级科研机构5个
国家级科研机构：国家“111计划”肉类食品质量安全控制及营养学创新引智基地、国家肉品加工技术研究分中心、中国畜产品加工研究会、国家肉品质量安全控制工程技术研究中心、中美食品安全与质量联合研究中心省部级科研机构：农业部肉及肉制品质量监督检验测试中心（南京）、业部农产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室（南京）、农业部生鲜猪肉加工技术集成科研基地、农业部肉品加工重点实验室、教育部肉品加工与质量控制重点实验室
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