同济大学医学院科研平台截至2021年6月，学院有国家创新研究群体2个，教育部重点实验室2个，教育部创新团队1个，基础科学中心1个，上海市重点实验室2个，建有国家（华东）干细胞库、上海干细胞临床转化研究院

 科研平台及团队类别名称国家科技资源共享服务平台国家干细胞转化资源库科技部国际科技合作基地（国际联合研究中心）干细胞与再生医学国际联合研究中心教育部重点实验室心律失常教育部重点实验室脊柱脊髓损伤再生修复教育部重点实验室教育部创新团队心脏颤动的发生机制和干预策略的理论基础上海市重点实验室上海市结核病（肺）重点实验室上海市母胎医学重点实验室上海市工程研究中心上海市干细胞临床诊疗工程研究中心上海工程技术研究中心上海人工心脏与心衰医学工程技术研究中心上海超声诊疗工程技术研究中心上海肺移植工程技术研究中心上海人体肠道菌群功能开发工程技术研究中心上海中药外用制剂创新工程技术研究中心上海市临床医学研究中心上海市感染性疾病（结核病）临床医学研究中心其他同济大学智能康复临床研究中心 同济大学医学院中德精神卫生研究所同济大学医学院呼吸病研究所 

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