国家超级计算深圳中心基本环境

国家超级计算深圳中心基本环境深圳超算采用由中科院和曙光公司联合研制的曙光6000超级计算系统,该系统整体计算能力实测峰值为1.271千万亿次浮点运算(1.271PFLOPS)

于2011年11月16日投入运行

为了方便管理和使用,曙光6000超级计算系统高性能计算区分成5个逻辑分区,分别为科学计算分区(GK)、工程计算分区(GG)、生命科学计算(GS)、胖节点分区(Fn)以及龙芯计算分区(Lx)

其中GK、GG、GS分区的每个计算节点由2颗Intel5650六核心处理器组成、主频2.66GHz,配置24GBDDR3内存以及1块Nvidia C2050 GPGPU卡,一块本地2.5 SAS硬盘,一块QDRIB子卡

胖节点分区(Fn)共配臵128台4路A840 SMP计算节点,每个计算节点配臵4颗AMD 6136八核心处理,主频2.4GHz,内存128GB

龙芯分区(Lx)共配臵320台龙芯节点,每个节点配臵1颗AMD64双核CPU和8颗龙芯处理器,20G内存,1块DDRIB网卡

曙光6000超级计算主机系统的存储分为两种:每个计算节点配备的本地磁盘;由存储节点建立的高速并行文件系统

其中本地硬盘严禁普通用户使用,仅供计算节点操作系统使用,用户的所有操作都应该在账号所对应的$HOME(该$HOME所在的位臵为高速并行文件系统)下进行,用户登录时,会自动被引导到自己账号的$HOME下面

鉴于存储空间的有限和数据安全的考虑,请用户务必做到及时下载计算结果文件并清理空间

用户可以使用VPN进入登录节点,该登录节点主要用于登录超算内网、使用LSF作业调度系统提交作业,禁止在登录节点运行程序、编译及数据上传下载

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