中国科学院湿地研究中心主要任务将我院从事湿地研究的科研力量联合起来，组织重大科研课题的调研与申请；组织开展湿地基础理论研究，建立我国的湿地科学体系；掌握国内外湿地研究信息，建立我国湿地数据库；研究不同自然地区湿地资源开发、经济发展战略、生态环境及重大工程建设等方面的问题，提出对策，建立不同区域湿地合理开发、持续发展模式，为国家或地方政府决策提供科学依据
通过课题研究和举办研讨会等，联合院内外湿地研究领域的骨干人才，培养一批跨世纪的青年学者和学术带头人；开展与国际湿地研究机构和学者的合作，成为参与国际合作的有权威性的研究机构，多次召开工作会议
协助国家林业局编制《中国湿的保护行动计划》，主办了有关学术研讨会，争取到GEF“中国湿地生物多样性保护”项目子合同1项，参加子合同1项
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