海南热带海洋学院科研机构截至2022年11月，学校有院士工作站4个、院士创新中心1个、国家级研究中心1个、教育部重点实验室1个、文化和旅游部重点实验室1个、省级救护保育中心1个、省级重点实验室（含筹建）4个、省级研究中心3个、省级研究基地5个、省级监测中心（筹建）1个、市级实验室10个、其他等级科研平台5个

  院士工作站：朱蓓薇院士工作站、杨志峰院士工作站  院士创新中心：朱蓓薇院士团队创新中心 国家级研究中心：国家海洋食品工程技术研究中心南海研发中心暨海南海洋食品创新研究院 教育部重点实验室：热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室 文化和旅游部重点实验室：海岛旅游资源数据挖掘与监测预警技术文化和旅游部重点实验室 省级救护保育中心：海南省海龟救护保育中心 省级重点实验室（含筹建）：海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室、海南省两栖爬行动物研究重点实验室、海南省近岸海洋生态环境与碳汇重点实验室、海南省海洋生物技术重点实验室（筹）  省级研究中心：海南省海洋食品工程技术研究中心、海南省海洋测绘工程研究中心、海南省现代化海洋牧场工程研究中心 省级研究基地：海南民族教育重点研究基地、海南省民族研究基地、海南省国际海岛休闲度假旅游研究基地、海南省南海文明研究基地、海南省自由贸易港邮轮游艇研究基地 省级监测中心（筹建）：海南省海洋资源环境监测中心（筹） 市级实验室：三亚碳计量与应用研究实验室、三亚市野生灵芝研究重点实验室、三亚市热带植物分子育种实验室、三亚市两栖爬行动物研究实验室、三亚新能源新材料重点实验室、三亚市计算机视觉重点实验室、三亚市热带海洋功能性食品研发及海洋食品安全研究重点实验室、三亚市功能槟榔研究重点实验室、三亚市海水增养殖研究重点实验室、三亚滨海耕地地力保育重点实验室 其他等级科研平台：海洋观测研究所、铸牢中华民族共同体意识研究中心、马来西亚研究中心、三亚旅游商品协同创新中心、上海合作组织大学区域学中方研究中心  

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