理藩院下属司务厅：司务满洲蒙古各一人，题署主事满洲三人，蒙古五人

掌院吏员、通事、差役事务，收内外札萨克及各省督抚衙门文书；蒙古翻译房：员外郎、主事各一人

掌蒙文翻译及蒙文题本事件；满档房：堂主事满洲一人，蒙古三人，笔贴式满洲四人，蒙古六人，经承四人

掌院奏折及人事；汉档房：堂主事满洲汉人各一人，笔贴式满洲七人、蒙古六人，经承三人，校正汉文官二人，掌缮写题本及翻清译汉与保管档案；饭银处：司员满洲蒙古各一人，帖写书吏一人，掌本院额定出入饭银及其他经费开支；俸档房：堂主事满洲蒙古各一人，笔贴式满洲蒙古各四人，掌全院官员额定俸银俸米开支等事；当月处：由各司郎中、员外郎、主事轮流值班，掌收在京衙门文书；督催所：满蒙司员各一人，笔贴式十六人，经承二人，掌稽查全院文移、注销等事；唐古特学：司业，助教各一人，笔贴式蒙古四人，教习唐古特文字（藏文），翻译藏文章奏文稿；内外馆：稽查监督二人，管理来京蒙古人 ；俄罗斯馆：助教满洲汉人各一人，监督、提调官、领催各一人，管理俄罗斯在京商人、传教士、学生诸事；托忒学：由唐古特学司业、助教兼管，另设学务司员二人，教授拖忒文字；蒙古官学：助教一人，学务司员、教习各二人，教习蒙文，培养蒙文翻译等；喇嘛印务处：掌印大喇嘛一人，看守印务德木齐四人，负责京师地区等喇嘛事务；则例馆：纂修官四人，校对官八人，翻译官、誊写官各十人，负责修纂《理藩院则例》

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