理藩院部门设置理藩院分院司两级，院部有尚书、左右侍郎和额外侍郎为最高领导，下属机构有六司一厅三房，即旗籍清吏司、王会清吏司、典属清吏司、柔远清吏司、徕远清吏司、理刑清吏司六司；司务厅；满档、蒙古、汉档三房；还有机关服务机构，入银库、当月处、饷银处和督摧处；此外有附属机构内馆、外馆、俄罗斯馆等
对地方的派出机构，设有神木理事司员、宁夏理事司员、热河都统衙门、理事司员等十二司员
理藩院内除众多完备的辅助机构外，还置有民族语言学校，如唐古特学，掌教习唐古特藏文，翻译藏文章奏文稿
拖忒学，掌翻译托忒文字，由唐古特学习业助教兼管
蒙古官学，掌教习蒙文，培养蒙文翻译
以上内容由大学时代综合整理自互联网，实际情况请以官方资料为准。
