中国工程院成立以后1994年6月3日，中国工程院在北京成立，同时设立院士制度

中国工程院院士每两年增选一次

 1995年，《中国工程院章程》正式通过

 1996年，中国科学院和中国工程院决定，今后两院院士大会同时同地联合举行，时间定在每逢双年6月的第一个星期

 1997年，在英国召开的国际工程与技术科学院理事会（CAETS）年会上，中国工程院顺利加入

1998年11月10日，中国工程院主席团研究决定设立中国工程院教育委员会

 1999年2月25日，中国工程院决定成立《中国工程科学》杂志社，并创办《中国工程科学》杂志；4月8日，中国工程院管理科学与工程委员会成立大会召开；11月8日《中国工程科学》创刊

 2000年9月25日，工程管理学部举行成立大会，首批院士32人；10月11日，2000年国际工程科技大会在人民大会堂召开

 2001年，在中国工程院的主持下，召开了CAETS年会；7月，中国工程院与上海市人民政府合作委员会在上海成立；12月20日，产业工程科技委员会成立

 2002年3月3日，中国工程院产业工程科技委员会薄板坯连铸连轧技术交流与开发协会成立大会召开

 2003年10月，沈国舫代表中国工程院向浙江省“中国工程院院士之家”授牌

 2004年8月23日，中国工程院产业工程科技委员会金属矿产资源综合利用技术开发与交流研究会成立大会在四川成都召开

 2005年1月13日，由工程院、中科院共同主办的两院院士评选的“振邦杯2004年中国和世界十大科技进展”在京揭晓

2月27日，由中国工程院出版委员会与人民交通出版社发起成立的中国土木、建筑与交通科技出版专家委员会成立大会暨第一次会议在京召开

4月29日，两院资深院士联谊会在京成立

6月23日，中国工程院工程研究院所研究生教育学术委员会召开成立大会

 2006年9月22日，中国工程院产业工程科技委员会表面活性剂研究开发促进会成立大会在京召开

11月5日，徐匡迪院长和法国工程院院长Francois Guinot共同出席上海大学中欧工程技术学院揭牌仪式

 2007年3月，办公厅原综合处更名为行政后勤处，计划财务处更名为财务处；学部工作局原9个学部办公室调整合并为学部工作一处和学部工作二处，并成立咨询工作处；国际合作局原双边合作处、多边合作处调整为一处、二处，撤销咨询调研处；政策研究室原出版处更名为综合处，信息宣传处更名为宣传处（新闻办公室），新成立信息中心

 2008年6月24日，中国工程院院士书画社成立

 2009年4月，院机关召开工会成立大会，选举产生院机关第一届委员会委员和经费审查委员会委员

 2010年12月5日，工程院主席团会议审议通过《中国工程院院士增选工作实施办法》

 2014年3月8日，中国工程院与杭州市人民政府关于建设智能城市战略合作框架协议签字仪式在工程院举行

3月14日，被评为“全国节能型公共机构示范单位”

 2016年8月18日，中国工程院、中国科学院和北京市人才工作领导小组在京联合召开“首都院士之家”揭牌仪式暨“院士怀柔行”见面会

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