关键词： 毛凤彪、赵晓璐、李开龙、CRISPRepi数据库

2024年11月12日，北大第三医院基础医学研究中心毛凤彪研究员、生殖医学中心赵晓璐副研究员团队与北京大学基础医学院李开龙副研究员联合在《Nucleic Acids Research》（《核酸研究》IF:16.6）杂志上在线发表题为《CRISPRepi: CRISPR表观基因组编辑的多组学图谱》的研究论文。

研究团队整合了来自多种表观基因组编辑系统的组学数据，包括RNA-seq、ChIP-seq、Bisulfite-seq以及ATAC-seq等数据，构建了一个涵盖人类和小鼠等6个物种的多组学数据库——CRISPRepi。该数据库聚焦于表观基因组编辑多组学数据的收录和整合，旨在帮助研究人员搜索和选择最佳的编辑设计，为评估基于CRISPR的表观基因组编辑系统的编辑效率和脱靶效应提供了一个综合的资源平台。

表观遗传在基因表达调控中扮演着至关重要的角色，基于CRISPR的表观基因组编辑技术可将CRISPR系统的靶向能力与表观遗传信息的重塑相结合，为研究人员提供了探索基因表达调控机制的新途径。CRISPRepi收集整合了6个物种的多种组学数据，包括人类、小鼠、拟南芥、黑腹果蝇、褐家鼠和大肠杆菌，共计671个精心整理的数据集，涉及87种细胞类型、283个靶基因、74种表观基因组编辑系统、5种Cas蛋白和35种效应蛋白以及5962条sgRNA。CRISPRepi整合了用于分析编辑结果和评估脱靶效应的工具，能够分析编辑前后的基因表达变化，以及相应表观遗传图谱的改变。

CRISPRepi数据库的建立旨在解决表观基因组编辑数据分散的问题，为科研人员提供一个强大而便捷的工具，有助于深入了解不同编辑系统的效果，优化sgRNA设计，评估脱靶效应，推动表观基因组编辑技术在基因功能研究和疾病治疗等领域的应用。未来，研究团队计划进一步扩大数据集覆盖范围并整合先进的分析工具，同时探索与其他生物信息算法的集成，以不断提升数据库的功能和实用性。

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