中国医学科学院学科建设据2018年8月中国医科院官网显示，中国医科院拥有一级学科博士授权专业点8个、一级学科硕士授权专业点3个；一级学科国家重点学科2个，二级学科国家重点学科8个，三级学科国家重点学科2个，国家重点培育学科1个

一级学科博士授权专业点：生物学、基础医学、临床医学、药学、生物医学工程、公共卫生与预防医学、中西医结合 二级学科博士授权专业点：动物学、生理学、遗传学、细胞生物学、生物化学与分子生物学、生物物理学、生物医学工程、人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、放射医学、比较医学、内科学（心血管病）内科学（血液病）、内科学（呼吸系病）、内科学（消化系病）、内科学（内分泌与代谢病）、内科学（肾病）、内科学（风湿病）、内科学（传染病）、儿科学、神经病学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、外科学（普外）、外科学（骨外）、外科学（泌尿外）、外科学（胸心外）、外科学（神外）、外科学（整形）、妇产科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、康复医学与理疗学、麻醉学、急诊医学、围术期医学、变态反应学、重症医学、心理医学、干细胞与再生医学、输血医学、流行病与卫生统计学、中西医结合基础、中西医结合临床、药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学、护理学、基础护理学、临床护理学、社区护理学一级学科硕士授权专业点：口腔医学、中药学、图书馆、情报与档案学二级学科硕士专业授权点：科学技术哲学、高原医学、口腔临床医学、营养与食品卫生学、生物制品学、中药学、社会医学与卫生事业管理、情报学专业学位博士授权点：内科学、儿科学、老年医学、神经病学、精神病与精神卫生学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、外科学、妇产科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、康复医学与理疗学、运动医学、麻醉学、急诊医学、中西医结合临床专业学位硕士授权点：工程硕士（生物医学工程）、内科学、儿科学、老年医学、神经病学、精神病与精神卫生学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、临床检验诊断学、外科学、妇产科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、康复医学与理疗学、运动医学、麻醉学、急诊医学、中西医结合临床、全科医学、临床病理学、口腔医学硕士、公共卫生硕士、护理、药学 一级学科国家重点学科：生物学、药学二级学科国家重点学科：免疫学、病理学与病理生理学、皮肤病与性病学、影像医学与核医学、妇产科学、肿瘤学、麻醉学、内科学三级学科国家重点学科：外科学（胸心外）、外科学（骨外）国家重点（培育）学科：外科学（普外）国家中医药管理局重点学科：药用植物学一级学科北京市重点学科：基础医学、临床医学、护理学、生物医学工程二级学科北京市重点学科：神经病学、眼科学、流行病与卫生统计学交叉学科北京市重点学科：转化医学三级学科北京市重点学科：外科学（普外） 博士后流动站：基础医学、临床医学、生物医学工程、公共卫生与预防医学、药学、生物学

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