中国医学科学院合作交流院校十分重视开展国际学术交流与科技合作，与数十个国家（或地区）的医学院校和科研机构建立了科研、教育、医疗领域的合作关系，有200余名国外专家学者被授予名誉教授或客座教授，其中包括数位诺贝尔奖获得者

经国务院学位委员会批准，我校分别授予马耳他共和国前总统文森特?塔博恩和美国中华医学基金会前主席布坎南、施瓦茨名誉医学博士学位

美国前总统克林顿、世界卫生组织前总干事李钟郁先生都曾到院校访问交流

自1985年以来，我校相继与美国哈佛大学医学院、美国加州大学旧金山分校医学院、美国密歇根大学医学院、澳大利亚西澳大学医学院及香港中文大学医学院签订了校际交流协议，彼此交换高年级学生到对方学校进行短期临床学习

经国家教育部批准，1993年起学校可自行接收政府计划外自费留学生，1997年起又获准招收我国台湾、香港和澳门地区学生来校学习

院校已成为国际医学科学研究组织正式成员单位

在2002年教育部、卫生部签署共建协议的基础上，在国务院领导同志和教育部、卫生部的大力支持和推动下，2006年9月，我校与清华大学实行紧密合作办学，可同时使用“北京协和医学院--清华大学医学部”作为第二名称，学校仍为独立法人单位，并进入“211”和“985”工程建设行列

两校强强联合办学，共同探求中国高等医学教育改革的创新模式

2017年12月6日，中国医学科学院与牛津大学合作成立中国医学科学院牛津研究所(CAMS Oxford Institute)，是在中国在海外成立的第一个医学研究所，旨在推动对疾病的认识和研究新的疗法，同时依托研究所吸收中国最好的医学生加入，培养一流人才

中国医学科学院牛津研究所将聚焦医学科技创新前沿交叉领域，携手解决中英两国乃至全球面临的重大医学与健康问题，为构建人类命运共同体书写新的篇章

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