波恩大学在2024年QS世界大学排名中排名第239名。

波恩大学前身为科隆公国学院，成立于1777年，有四个院系：神学，法律，医学，世界学。 1784年德国皇帝约瑟夫二世对其学业证明在整个神圣罗马帝国给予认可，因此由学院提升成为大学。 1798年随着莱茵河左岸被法国吞并科隆选帝侯国大学取消。 1860年5月，德国第一个艺术史研究大学教席在波恩大学设置。 1868年荣获医学院荣誉博士头衔的路易·巴斯德由于1870年的德法战争放弃头衔。 文学院长剥夺了托马斯曼的名誉博士学位，二战后被再次授予。 1934年成立大学农学院，其前身是泊波尔斯多夫农业大学。 1944年10月18日空袭摧毁了波恩大学主楼（科隆选帝侯宫殿）。 战争结束后的1945/46冬季学期由于恢复重建工作，校长办公室迁至过渡性建筑。 由于战争破坏和学生增加建设工作是必要的，波恩大学新修建了一栋建筑作为图书馆，其对面修建了一栋建筑作为法学院。 大学附属医院甚至完全从内城迁出重新奠基。

波恩大学的数学专业在QS世界大学学科排名中位列全德第1，世界第43名；在ARWU世界大学学术排名中位列全德第1，世界第29名；并在USNews世界大学学科排名中位列全德第1，世界第34名。这一优势使得波恩大学成为数学领域的顶尖学府。同时，波恩大学的经济学专业在蒂尔堡大学的“全球经济学研究机构排名”中位列全德第1，世界第22名。而在ARWU世界大学学术排名中，该专业位列全德第1，世界第35名。波恩大学的经济学专业以其优质教育和卓越研究而闻名。

此外，该专业师资力量强大，拥有多位著名的数学家和数学界领袖，如亚历山大·格罗滕迪克、米歇尔·阿图因等。

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