中国古文献研究中心机构前身北京大学中国古文献研究中心的前身，其历史可上溯至1959年，当时为了使古籍整理研究工作后继有人，在国家委托及老一辈学者的支持下，北京大学创建了中国古典文献专业
文革之后，为抓好全国高校的古籍整理研究与人才培养工作，经教育部批准，于1983年成立了全国高等院校古籍整理研究工作委员会，负责组织协调全国高校古籍整理的科学研究与人才培养工作，包括重点古籍整理研究项目的规划、审定和项目进展工作的检查与指导等
1984年由教育部批准，在原北京大学中文系古典文献专业和古文献研究室的基础上，建立了北京大学古文献研究所，建所至今，也已经有了18年的历史
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