北京大学公共卫生学院科研机构据2020年6月北京大学公共卫生学院官网显示，公共卫生学院拥有省部级重点实验室3个，此外有校级联合研究中心4个，院级联合研究中心3个
省部级重点实验室：卫生部生育健康重点实验室、食品安全毒理学研究与评价北京市重点实验室、国家中医药管理局中药配伍解毒重点研究室 校级联合研究中心：循证医学中心、营养与保健食品评价中心、老年健康服务研究中心、北京大学卫生应急管理中心 院级联合研究中心：艾滋病预防研究中心、预防医学实验教学中心、药品上市后安全性研究中心
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