清华大学理学院学科设置在清华大学行政管理体制的框架下，理学院院级行政管理属于虚体建制，下设四个实体建制的理科系
数学科学系设置数学与应用数学、信息与计算科学两个本科专业，物理系设置物理学本科专业，化学系设置化学本科专业，生物科学与技术系设置生物科学本科专业
数学、物理学、化学、生物学均为一级学科博士和硕士学位授予点
理学院现设有数学、物理学、化学和生物学四个博士后流动站
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