南京大学环境学院科研平台根据2022年2月学院官网信息显示，学院有国家重点实验室1个，国家工程技术研究中心1个，清洁水协同创新中心1个，省部级科研机构6个，校级科研机构7个，产学研合作平台14个

学院还拥有国家自然科学基金创新研究群体1个、教育部/科技部/江苏省/中石化协会创新团队5个

 国家重点实验室：污染控制与资源化研究国家重点实验室 国家工程技术研究中心：国家有机毒物污染控制与资源化工程技术研究中心 清洁水协同创新中心：水污染控制先进技术与装备协同创新中心 省部级科研机构：教育部水处理与水环境修复工程研究中心、国家环境保护有机化工废水处理与资源化工程技术中心、南京大学环境科学研究所、江苏省农村环境保护与生态修复工程中心、南京大学-江苏省环境保护厅环境管理与政策研究中心、江苏省大气污染控制联合实验室 校级科研机构：南京大学地球关键带科学与技术国际研究中心、南京大学国际环境科学中心、南京大学环境纳米技术研究中心、南京大学湖沼研究中心、南京大学有毒化学品环境安全研究中心、南京大学环境健康与生态风险研究所、南京大学EHS研究中心 产学研合作平台：南京大学宜兴环保研究院、南京大学盐城环保技术与工程研究院、泉州南京大学环保产业研究院、南京大学常高新国际环保产业技术研究院、南京大学（溧水）生态环境研究院、南京扬子江生态文明创新中心、南京环保产业创新中心有限公司、南京大学重庆创新研究院、南京江岛环境科技研究院有限公司、南京大学江宁环保技术创新研究院、南京大学绿色发展与清洁技术研究院、南京博域环保技术研究院、南京盛滨环境研究院有限公司、南京全凯生物基材料研究院 

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