厦门大学药学院科研平台根据2017年12月学院官网信息显示，学院有海洋活性物质功能、质量和安全性评价技术平台（国家海洋局-厦门市），国家海洋局“十三五”海洋经济创新发展示范城市项目1个，教育部创新团队1个，福建省重点实验室1个，市级科研平台6个，共建研究机构3个；参与建设两岸关系和平发展协同创新中心（国家级）、细胞信号网络协同创新中心（国家级）
教育部创新团队：“核受体肿瘤分子靶点与药物开发”创新团队 国家海洋局“十三五”海洋经济创新发展示范城市项目：南方海洋创新药物研发平台福建省重点实验室：福建省新药物靶点研究重点实验室 市级科研平台：厦门化学创新药研发重大平台、厦门市代谢性疾病重点实验室 、厦门市肿瘤细胞与分子诊疗重点实验室、厦门市靶点新药工程技术研究中心、厦门市林下中药资源工程技术研究中心、厦门生物医药协同创新中心共建研究机构：厦门大学药学院―元生泰生物医药研发中心 、厦门大学药学院--柘荣县生物医药研发中心 、厦门大学药学院--安特诺细胞医药研发中心
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