南京农业大学园艺学院科研平台截至2014年5月，学院有教育部工程研究中心1个，农业部重点实验室1个，农业部重点开放实验室1个，江苏省级科研机构2个，校级科研机构7个，江苏省现代农业产业技术创新团队3个，江苏省“青蓝工程”科技创新团队培养对象1个
教育部工程研究中心：教育部园艺作物种质创新与利用工程研究中心 农业部重点开放实验室：农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室 农业部重点实验室：农业部华东地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 江苏省级科研机构：江苏省果树品种改良与种苗繁育中心 、江苏省花卉培育工程技术研究中心 校级科研机构：南京农业大学果树研究所、南京农业大学蔬菜研究所、南京农业大学茶叶科学研究所、南京农业大学花卉研究所、南京农业大学中药材研究所、南京农业大学设施园艺工程技术中心、南京农业大学园林景观规划设计研究所 江苏省“青蓝工程”科技创新团队培养对象：梨树功能基因组学与应用创新团队 江苏省现代农业产业技术创新团队：“十字花科蔬菜育种”创新团队、“设施蔬菜高效栽培”创新团队、“特种花卉品种”创新团队
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