新疆农业大学科学技术学院科研创新近三年，专任教师承担省部级以上科研项目32项；组织开展院级教研项目17项；第一作者发表论文91篇
2013年设立了青年科研启动基金，立项6项
同时，组织开展大学生科技创新基金项目65项，发表论文26篇
多年来，学院自主研发并推广运用了课外网络学习平台、FTP资源搜索引擎、专业选择系统、学生操行记录查询系统、电子阅览室预约系统、财务收费管理系统等9项应用系统；机电工程系通过自主创新，有效实现对LED（大小为16cm×8cm的双基色点阵）、LCD（全彩）、通信及语音模块的控制和开发，运用“预约系统”建立了无人监管的“开放实验室”；教研项目“单片机与接口技术”和“传感器与检测技术”课程标准的制定以及“生物技术综合大实验”、“建筑工程VR仿真”、“设备设计与暖通负荷”的创新与实践，对于培养学生动手、应用能力起到积极有效的作用
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