内蒙古科技大学包头医学院学科建设学校自1980年开始招收硕士研究生，1986年获批硕士学位授权单位
截至2022年4月，有临床医学、基础医学、公共卫生与预防医学、生物学、马克思主义理论等5个一级学科硕士学位授权点，人体解剖与组织胚胎学1个二级学科硕士学位授权点，临床医学、公共卫生、药学3个硕士专业学位授权点
学校现有国家临床医学重点专科1个，内蒙古自治区医疗卫生领先学科5个、重点学科4个，内蒙古自治区高等学校重点学科4个、重点培育学科2个
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