同济大学医学院科研成果截至2021年6月，学院近五年来科研总立项经费达14.6亿元，获批国家重点研发计划首席项目9项，承担国家自然科学基金项目1038项，在Nature、Science、Cell等影响因子20分以上期刊发表学术论文31篇；获国家科技进步二等奖3项，省部级自然科学奖、科技进步奖、技术发明奖、科学技术普及一等奖等近20项

 国家科学技术奖获奖年度级别项目名称第一完成人2005国家自然科学二等奖心房颤动分子遗传学和细胞电生理学研究陈义汉 2018国家科学技术进步二等奖《图说灾难逃生自救丛书》刘中民 2019国家科学技术进步二等奖肺癌精准诊疗关键技术研究与推广应用周彩存 2020国家科学技术进步二等奖血管通路数字诊疗关键技术体系建立及其临床应用张海军 高等学校科学研究优秀成果奖获奖项目年度级别项目名称2012科技进步奖一等奖肝癌等难治性肿瘤介入新疗法的建立和应用科技进步奖一等奖泌尿系肿瘤的生物学行为的研究和个体化策略治疗科技进步奖二等奖肠道免疫应答和微生物调节异常诱导肠黏膜炎症发生机制和临床应用2013自然科学奖二等奖慢性低度炎症在肥胖及脂代谢紊乱中的致病机制研究科技进步奖二等奖骨盆环肿瘤外科治疗关键技术创新与临床应用科技进步奖二等奖中医气血学说论治心脑血管病体系的构建与应用科技进步奖二等奖超声造影规范化应用和提高其诊断水平的系列研究2014自然科学奖二等奖四肢远端蒂皮瓣的基础与临床研究2015自然科学奖一等奖生物标志物在大肠癌早期预警、预后监测及靶向治疗的应用基础研究2016科技进步奖二等奖玻璃体视网膜增生性疾病的基础研究和临床转化科技进步奖二等奖阿尔茨海默病分子生物学分子功能影像学精准评价及干细胞治疗研究2017自然科学奖一等奖固有免疫中的信号转导机制研究科技进步奖二等奖肉毒毒素临床基础研究及应用新技术开发2018技术发明奖一等奖医用材料表面改性技术及临床应用科技进步奖二等奖早期肺癌精准诊疗体系的建立与应用科技进步奖二等奖甲状腺癌基础研究和临床治疗关键技术的建立与应用2020自然科学奖一等奖C型凝集素受体介导机体抗真菌感染的免疫新机制 

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