齐齐哈尔医学院校旗齐齐哈尔医学院院旗由三种颜色构成，即绿色、白色和红色，绿色为主色，白色和红色为辅色，绿色旗面上嵌有院徽、中英文院名和变形十字
变形十字象征人道主义保护，意指志愿守护人类健康
绿色：代表健康，象征希望，寓意为绿色通道、青春活力、生命至上、生态环保
白色：代表纯洁，象征神圣，寓意为白衣天使、诚信廉洁、医术圣洁、医德高尚
红色：代表热烈，象征喜庆，寓意为医学教育事业发展的勃勃生机
齐齐哈尔医学院院旗集院标、院名于一体，集中展示学院形象
整体设计突出医学、教育、发展、和谐的理念，体现了齐医人除人类之病痛，助健康之完美，为祖国医药卫生事业的发展和人类身心健康不懈奋斗的执着追求
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