厦门医学院院系设置截至2023年2月，学校设有11个教学机构、3个教学辅助机构，有2所直属附属医院、3所非直属附属医院、41所教学医院和112个校外实训基地，开设15个本科专业、9个专科专业
教学机构厦门医学院临床医学系厦门医学院口腔医学系厦门医学院护理学系厦门医学院药学系厦门医学院公共卫生与医学技术系厦门医学院基础医学部厦门医学院公共课教学部厦门医学院马克思主义学院厦门医学院继续教育部（国际教育培训中心、海外教育部） 本科专业序号专业名称1助产学2护理学3中药学4海洋药学5药学6生物制药7预防医学8口腔医学9临床医学10麻醉学11精神医学12医学检验技术13康复治疗学14化妆品技术与工程15口腔医学技术 专科专业序号专业名称1助产2护理3卫生信息管理4医学美容技术5健康管理6口腔医学技术7针灸推拿8眼视光技术9康复治疗技术
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