厦门医学院学校荣誉学校先后被授予“全国卫生系统先进集体”、“省级文明学校”、“省高校信息化先进单位”、“省生命教育示范学校”、“省先进基层党组织”、“省法律进学校先进单位”、“市平安先行学校”、“市花园式学校”、“高职院校心理健康教育工作先进集体”、“校综治安全目标管理先进单位”等荣誉称号
2020年12月25日，被国家卫生健康委等授予“无偿献血促进奖”
2021年12月，被省教育厅认定为“福建第一批省级平安校园”
2022年5月，厦门医学院护理学系团总支荣获2021年“福建省五四红旗团（总）支部”称号
2022年11月，厦门医学院团委被表彰为全国红十字模范单位
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