新疆第二医学院科研成果据2022年10月学校官网显示，学校获批科研项目160余项，其中国家级项目12项，省部级项目73项，厅局级项目80余项

教师发表中外文论文900余篇，其中SCI收录89篇，中文核心期刊150余篇

2022年9月16日，自治区科技厅公示《关于对2022年第二批自治区创新环境（人才、基地）建设专项--自然科学基金项目拟立项》通知，新疆第二医学院成功获批7项青年科学基金项目，资助经费总额49万元

  2022年第二批自治区创新环境（人才、基地）建设专项—自然序号所属学院项目名称项目承担人1公共卫生学院新疆地区常见天然抗氧化产物对雄性生殖毒性拮抗作用的机制研究安红梅2公共卫生学院3-甲基腺嘌呤在砷致肝纤维化的（NF-κB）信号通路中的作用研究惠瑜3护理学院基于Haddon模型的克拉玛依地区儿童意外伤害的流行病学调查及综合干预效果评价季玲4基础医学院药桑椹总黄酮对类风湿关节炎中滑膜细胞和炎症反应的调控作用研究张荣5药学院基于核酸适配体和纳米材料的生物传感器在食品中甲硝唑残留快速检测的研究与应用袁洁6药学院基于脱氧核糖核酸（DNA）纳米材料和杂交链式反应联用策略的生物传感器在食管癌多肿瘤标志物检测中的应用研究王瑞珂7药学院阿尔泰金莲花总黄酮提取工艺优化及其抗菌活性成分的鉴定与作用机理研究姜敏

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