中国科学院生物物理研究所设施资源设备设施截至2014年08月，研究所建设了中科院蛋白质科学研究平台和北京磁共振成像中心，为科研提供完备的公共技术支撑，同时开展实验方法学和实验技术创新研究，并面向社会开放共享

 蛋白质科学研究平台拥有一批以300千伏低温透射电子显微镜、高强度X射线衍射晶体结构数据收集系统、OMX结构照明显微镜、高分辨率质谱分析仪等为代表的大型仪器设备以及符合中国国家标准的免疫缺陷实验动物中心等大型设施；平台已经成为中国生命科学基础研究领域水平最高的公共技术支撑系统之一

 大型仪器列表120KV透射电子显微镜X射线衍射晶体数据收集系统BIACORE 3000生物大分子相互作用仪BiacoreT100生物大分子相互作用仪Marianas高速双转盘共聚焦显微镜FR-EITC等温滴定微量热仪300kv透射电子显微镜XL-I型分析超速离心机低温生物样品制备LeicaSCN400病理切片全景扫描和分析系统Helios NanoLab 600i 双束扫描电镜 LeicaSCN400病理切片全景扫描和分析系统静态光散射、示差系数、场流分析仪场流仪光敏定位超高光学分辨率显微镜（研制） 病理分析系统和冰冻切片LTQ Orbitrap XL质谱仪高通量蛋白质表达纯化及结晶技术平台BD Influx 流式细胞分选仪流式细胞仪FACSAriaIIIuOMX结构照明显微镜双光子共聚焦显微镜同位素实验室Pico-force Multi-Mode原子力显微镜 馆藏资源截至2022年08月，研究所现拥有1100平方米的图书馆，开通了科技文献数据库21个，可访问3000余种外文学术期刊和大部分中文学术期刊

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