中国科学院北京基因组研究所合作交流国际交流根据2015年12月研究所官网信息，中国科学院北京基因组研究所与沙特阿卜杜拉国王科技城共同参与国际合作项目椰枣基因组计划，进行了中美国际合作项目藏族高血氧饱和度的遗传机制研究，参与了中加国际合作项目：关联分析法定位急性心肌梗塞的致病风险因子 

研究所与韩国生物科学与生物技术研究所，沙特国王科技城国家基因组研究中心，英国皇家植物园等机构进行了学术交流活动

 院地合作截至2009年8月，中国科学院北京基因组研究所与国家人类基因组北方中心、国家海洋局第一海洋研究所、中国水产科学院黄海水产研究所、中国农业科学院作物科学研究所、广东省农业科学院兽医研究所、中国热带农业科学院橡胶所、北京大学、中国医学科学院、浙江大学、汕头大学、温州医学院、中山大学、中国农业大学、福建师范大学、江西农业大学、内蒙古大学、内蒙古农业大学、华南师范大学、第三军医大学、西安交通大学、上海交通大学、南京农业大学、浙江省农业科学院、瑞金医院、北京法医中心、北京出入境检验检疫局、山东省滨州港友发水产有限公司、浪潮集团等多家国内科研机构、大学、医院、科技公司和企业开展合作研究

合作研究的领域覆盖了微生物、病毒及高等生物线粒体全基因组及蛋白质组研究、利用EST或SAGE技术对多个物种进行基因表达及转录组研究、以及一些人类疾病相关基因的遗传连锁分析等

其中与浙江大学、浙江省农业科学院联合研究的“利用EST信息资源大规模克隆家蚕功能基因”项目，获得浙江省科技进步一等奖

 部分合作项目
项目名称建立时间合作机构中科院北京基因组研究所-舟山医院免疫基因组学联合实验室2006年舟山医院中国科学院基因组科学及信息重点实验室2006年浪潮集团有限公司基因转化科学联合实验室2013年河北省科学院生物所法医基因组协同创新中心2015年公安部物证鉴定中心基因组转化联合实验室2013年东阿县人民医院资料来源：  

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