中国科学院上海巴斯德研究所学科建设据2018年8月上海巴斯德所官网显示，上海巴斯德所设有1个博士后科研流动站、1个学术学位一级学科博士点、2个学术学位二级学科博士点、1个学术学位一级学科硕士点、3个学术学位二级学科硕士点、1个专业硕士领域
学科类别学科名称博士后科研流动站生物学学术学位一级学科博士点生物学学术学位二级学科博士点微生物学、细胞生物学学术学位一级学科硕士点生物学学术学位二级学科硕士点微生物学、细胞生物学专业硕士领域生物工程
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