中国科学院动物研究所学科建设据2023年3月研究所官网显示，中国科学院动物研究所共有4个一级学科和1个专业学位类别、9个二级学科专业博士培养点、11个二级学科专业硕士培养点
一级学科（4个）：生物学、生态学、基础医学、生物医学工程 二级学科专业博士培养点（9个）：动物学、基因组学、发育生物学、细胞生物学、生态学、免疫学、病理学与病理生理学、人体解剖与组织胚胎学、再生医学 二级学科专业硕士培养点（11个）：动物学、基因组学、发育生物学、细胞生物学、生态学、免疫学、病理学与病理生理学、人体解剖与组织胚胎学、再生医学、生物医学工程、生物与医药 专业学位类别（1个）：生物与医药
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