中国农业科学院上海兽医研究所研究成果据2017年12月研究所官网显示，研究所获各项科研成果奖励61项，其中国家级2项；获得国家发明专利66项；获得国家新兽药证书10项；出版专著53部，发表论文1900余篇

获奖项目：“农业血防综合治理新技术”荣获寄生虫领域第一个国家科技进步奖、研制成功的抗锥虫新药“盐酸锥双净”获国家一类新兽药证书、抗球虫新药“地克珠利”原料药及预混剂共获得3项国家二类新兽药证书和国家科技进步三等奖、“球虫病免疫预防苗（DLV疫苗）”为中国内地第一个获新兽药证书的球虫病免疫预防疫苗 研究所部分获得专利专利名称专利号获准日期用于检测弓形虫缓殖子的引物和探针及试剂盒ZL20121007252762014/9/3吉氏巴贝西虫重组抗原及其诊断试剂盒和应用ZL20121003568352014/7/2一种抗流感病毒的单链抗体及其制备方法和应用ZL20121006387042014/6/4猪瘟分支肽及其应用ZL20131006031842014/6/4一种鸭黄病毒及其疫苗、试剂盒ZL20101060105072014/4/16自发光材料用于化学发光Western blot的用途及其组合物ZL201320212523.32013/10/16一种虫卵孵化袋（实用新型）ZL201320243280.X2013/10/9一种喷鼻装置用可调节双喷头及喷鼻装置（实用新型）ZL201010575768.32013/10/9日本血吸虫蛋白质及其应用ZL201010575768.32013/9/11一类N-（2-噻唑）苯甲酰胺衍生物的应用ZL201010237252.82013/9/11一种硬蜱模型的转基因动物生物安全评价方法ZL201210044642.22013/9/11一种1型鸭病毒性肝炎RT-LAMP检测试剂盒及其检测方法ZL201110256049.x2013/8/14稳定表达高致病力禽流感病毒HA蛋白的MDCK细胞系及其用途ZL201010106774.42013/7/3一种三嗪化合物及其在控制鸡球虫病中的应用ZL201110230812.12013/7/3抗鸭坦布苏病毒的单克隆抗体、杂交瘤细胞株及其应用ZL201210030412.02013/6/19一种鸭疫里默氏杆菌LAMP检测试剂盒及其检测方法ZL201010290683.02013/6/12隐孢子虫CTL和Th混合多表位基因和融合蛋白及应用ZL201010200117.62013/6/5日本血吸虫硫氧还蛋白谷胱甘肽还原酶基因及其DNA疫苗ZL201110333898.02013/6/5含日本血吸虫基因的重组表达载体及其应用ZL200910057673.X2013/5/1一种判断人工抗原是否制备出来的方法ZL201010145055.32013/5/1猪瘟合成肽疫苗及其应用ZL201010539268.42013/3/27猪繁殖与呼吸综合征病毒感染性克隆疫苗株及其应用ZL201010559005.X2013/3/27猪繁殖与呼吸综合征病毒基因工程标记弱毒疫苗株及应用ZL201110146821.22013/2/27具有免疫原性的日本血吸虫多肽及其应用ZL200910201697.82012/12/19一种鸭源常见细菌多重PCR检测试剂盒及其检测方法ZL20111009369592012/11/7日本血吸虫SjLGL基因的siRNA及其应用ZL201110139530.02012/10/31犬流感重组病毒及其构建方法和应用ZL201110139528.32012/10/24检测犬猫钩端螺旋体感染的荧光定量PCR方法ZL201010138082.82012/10/10鼠尾静脉注射固定装置（实用新型）ZL20122004089432012/10/3重组杆状病毒及其构建方法和应用ZL201010115505.42012/9/19微小隐孢子虫Th多表位基因和融合蛋白及其应用ZL201010190205.22012/8/1柔嫩艾美耳球虫钙依赖蛋白激酶基因及应用ZL201010253537.02012/7/4一种亚洲璃眼蜱的组胺结合蛋白HaHBP的基因序列和重组表达与应用ZL200910053693x2012/5/23日本血吸虫Frizzle 9基因、蛋白及用途ZL2010102246452012/5/23一种镰形扇头蜱的抗凝血分子Rhipilin-1的基因序列和重组表达与应用ZL20091005369252012/5/9快速诊断家畜日本血吸虫病试纸条制备方法ZL 2006 1 0024699.02012/5/2一种生产大片吸虫组织蛋白酶L1的方法ZL200710039981.02012/5/2日本血吸虫β-catenin基因、蛋白及用途ZL201010239053.02012/5/2日本血吸虫重组多表位抗原及其表达、纯化方法与应用ZL 200810040382.52012/4/18吡喹酮注射剂及其制备方法和应用ZL200910057668.92012/2/1含日本血吸虫基因的重组表达载体及应用Zl200910057674.42011/12/14牛鼻环给药装置（实用新型）ZL201120093112.82011/12/14治疗断奶仔猪抗腹泻中药复方组合物ZL20101024395472011/8/31高等级生物安全实验室专用污水处理设备ZL201020637987.52011/6/29鹅细小病毒抗体间接ELISA检测试剂盒（实用新型）ZL201020298689.82011/5/18I型鸭肝炎病毒抗体间接检测试剂盒（实用新型）ZL201020298920.32011/5/18柔嫩艾美耳球虫蛋白质二硫键异构酶基因的克隆、表达及其应用ZL 2007 1 0047339.72011/5/4高致病性猪蓝耳病病毒重组质粒和遗传工程疫苗ZL200710172364.82010/11/24日本血吸虫信号转导蛋白Sjwnt-4基因的克隆、表达及应用ZL200610167531.52010/10/13复合型天然植物除臭剂ZL200710044704.92010/5/19一种快速筛选牛奶类液体样中抗菌药物残留的方法ZL200710046607.32009/10/28家蚕保健品及其制备方法ZL200610024701.42009/10/14无色孔雀石绿完全抗原与单克隆抗体制备技术ZL200510060994.72009/5/20倒置式集卵直孵器（实用新型专利）ZL200820056923.92008/12/31血吸虫毛蚴电子显示器（实用新型专利）ZL200720071248.22008/6/11镰形扇头蜱RhcA和RhcB基因的克隆、表达和抗蜱免疫保护作ZL 200410016414.X2008/3/19防治鸡、兔和山羊球虫病的中药复方制剂ZL03 1 50699.22007/1/17日本血吸虫中国大陆株SjPP基因及其克隆、表达和应用ZL2004 1 0017743.62006/8/30日本血吸虫（中国大陆株）MFS4基因的克隆、表达和DNA疫苗ZL03 1 15732.72006/4/5日本血吸虫中国大陆株抱雌沟蛋白的基因序列ZL02 1 10673.82005/8/10日本血吸虫脂肪酸结合蛋白基因的克隆及在家蚕系统中的表达ZL98 1 22043.62004/7/21一种吡喹酮缓释剂及制备方法ZL 98 1 10771.02002/12/11利用家蚕系统生产重组日本血吸虫谷胱甘肽—转移酶ZL96 1 16311.92001/1/27三嗪类衍生物及其制备方法ZL93 1 12460.32000/1/22 部分专著名单
论著名称出版社编写人员出版年份备注寄生虫虫学（上下册）上海科学技术出版社刘瑞三1964论著流行病学人民卫生出版社刘瑞三1964论著钩端螺旋体病的实验室诊断上海科学技术出版社刘瑞三1965论著上海血吸虫病防治手册上海人民出版社徐礼周1970论著动物寄生虫与人类健康——重要寄生虫病30种中国农业科学技术出版社黄兵2014----中国家畜家禽寄生虫名录（第二版）国农业科学技术出版社黄兵2014----动物病毒反向遗传学科学出版社刘光清2014---- 

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