中国科学院科技战略咨询研究院机构前身1985年6月至1987年是研究所初创时期

这一时期，研究所积极推进科研组织和队伍建设，特别是加强专业结构调整和科研体系建设，开展对外学术交流与合作

到1987年末，研究所全面展开研究工作的条件已基本具备

1987年1月，经与应用数学研究所协商，报经中国科学院批准，中国科学院应用数学所优选法与管理科学研究室划转科技政策与管理科学研究所

1988年至1992年，研究所组织管理和科研体系基本形成

面对科技体制改革带来的发展机遇与挑战，研究所着力把握发展大局，进一步优化和集成力量，增强科研能力和竞争力

1993至1999年，随着经济体制和科技体制改革的不断深化，科技政策和管理研究受到各级政府和企业的广泛关注

研究所在结构调整的基础上，进一步深化改革，力图加强研究所发展能力建设，为国家宏观管理部门和中国科学院有关决策提供支撑

2000年，研究所承担的中国科学院试点研究所评估工作和中国科学院自然与社会交叉科学研究中心建设工作纳入知识创新工程试点

2002年，研究所整体进入知识创新工程试点二期研究所序列，迎来了创新发展新阶段

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