中国科学院上海技术物理研究所科研平台截至2015年，研究所拥有国家重点实验室2个、中国科学院重点实验室3个、省部共建实验室1个；设有第二研究室、第四研究室、第五研究室、第八研究室、工程一室、工程三室、工程七室、工程九室等科研部门；是中国空间科学学会空间遥感专业委员会、上海红外与遥感学会的挂靠单位
国家重点实验室：红外物理国家重点实验室、传感器国家重点实验室（光传感器点） 中国科学院重点实验室：中国科学院红外成像材料与器件重点实验室、中国科学院红外探测与成像技术重点实验室、中科院空间主动光电技术重点实验室 省部共建实验室：现场物证光学探测技术联合实验室
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