中国科学院昆明植物研究所设施资源设施资源截至2015年5月，该所公共技术服务中心整合所内仪器设备共35 台（套） ，并纳入院大型仪器共享网管理

拥有400 兆、500 兆、600 兆核磁共振仪、液相-离子阱色谱质谱联用仪、液相-三重四极杆色谱质谱联用仪、三扇型磁质谱、高压液相色谱、气相色谱、气相色谱质谱联用仪、X-单晶衍射仪、圆二色散光谱仪、数字旋光仪、紫外分光光谱仪、红外分析仪等化学分析仪器设备；DNA 全自动遗传分析仪、Qiaxcel 全自动 DNA/RNA 分析系统、多功能遗传分析系统、基因组分析系统、调制叶绿素荧光成像系统、激光扫描共聚焦生物显微镜、超速离心机、大容量高速冷冻离心机、荧光定量 PCR 仪、流式细胞仪等分子生物学实验设备

此外，中心还配置了 800 兆核磁共振仪、MALDI-TOF-TOF 质谱仪、多套分析&制备型 HPLC-MS 联用仪、以及实验动物全面检测系统等多台套设备

 馆藏资源截至2015年5月，该所植物标本馆（KUN）馆藏标本140余万份，是全国第二大植物标本馆

标本馆收藏植物标本120 多万份，图书馆藏书27 万册

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