河南省农业科学院科研部门截至2022年7月，有70余个国家和省级研究平台依托河南省农业科学院建立；同时代管神农种业实验室
国家级科研平台：国家生物育种产业创新中心、小麦国家工程实验室、花生遗传改良国家地方联合工程实验室、农业部动物免疫学重点实验室、农业部黄淮中部小麦生物学与遗传育种重点实验室、农业部农产品质量监督检验测试中心（郑州）、农业部郑州潮土生态环境重点野外科学观测试验站、农业部农产品质量安全风险评估实验室（郑州）等 省级科研平台：河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室、河南省饲料与养殖环境控制工程技术研究中心、河南省水稻种质创新与品种改良工程技术研究中心、河南省智慧农业工程技术研究中心、河南省动物生物制剂工程研究中心、饲料质量安全控制河南省工程实验室、河南省蚕业科学研究院、河南省作物分子育种研究院、河南省林业科学研究院、河南省水产科学研究院、河南省农业科学院农副产品加工研究中心、河南省农业科学院园艺研究所、河南省农业科学院植物保护研究所等
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