四川大学华西医院研究机构机构概览据2015年4月医院官网信息显示，华西医院有国家重点实验室1个，卫生部重点实验室2个，中心开放实验室34个；设有中国循证医学中心，国家新药、中药安全性评价中心（GLP），国家药品临床研究基地（西药和中药GCP），国家新药药效评价中心，国家化妆品安全性和功效性检验机构等，还拥有中国规模最大、最早整体通过美国病理家学会（CAP）检查认可的医学检验中心

 国家重点实验室：生物治疗国家重点实验室 卫生部重点实验室：移植工程与移植免疫卫生部重点实验室、时间生物学卫生部重点实验室 其他研究机构干细胞与组织工程研究室人类疾病相关多肽研究室病理研究室核医学实验室医学遗传研究室呼吸病学研究室感染性疾病分子生物学实验室精神医学研究室麻醉与危重急救医学研究室心血管疾病研究室器官微循环与消化外科研究室信号转导及分子靶向治疗研究室肺癌分子生物学研究室血液肿瘤分子机制研究室华西临床磁共振研究中心 创新医学链华西医院已逐步形成了一条专业从事医药成果转化的华西转化医学研究链

2012年在四川省科技厅、成都市科技局和高新区政府支持下共建西部医药技术转移中心，并获批成为国家科技部“国家技术转移示范机构”，整合“政-产-学-研-资-用”转化医学资源优势，搭建了面向全国的、开放的技术转移服务平台

2014年底获批建设省内首家转化医学工程技术研究中心

与此同时，医院依托国家重点实验室、各开放实验室、公共技术平台、国家GLP中心、国家GCP基地、国家灵长类实验动物基地（国家级猕猴繁育基地，种群规模3000余头）、国家新药药效评价中心等平台，构建了从原始研发到生产流通的新药创制的创新产业服务链

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