中央研究院发展理化实业研究所于1927年11月筹设，下有物理组、化学组、工程组

1928年7月分立为中央研究院物理研究所、中央研究院化学研究所、中央研究院工程研究所，均在上海

地质调查所于1927年11月筹设，1928年7月成立地质研究所，在上海

中央研究院社会科学研究所于1927年11月筹设，1928年5月正式成立，下有法制组、民族组、经济组、社会组，前两组在南京，后两组在上海

1934年7月，中华教育文化基金董事会之北平社会调查所并入该所，1945年改称社会研究所

观象台于1927年11月更名，下有天文组、气象组

1928年2月分立为国立中央研究院天文研究所、气象研究所，均在南京

中央研究院语言历史研究所于1927年夏设于广州国立中山大学，1928年3月在中山大学筹设中央研究院历史语言研究所，10月22日迁入广州柏园正式成立，后迁北平

体质人类学研究所于1944年由史语所第四组中抽出另设，抗战胜利复员后因限于经费，又由史语所收回接办

国立中央研究院自然历史博物馆于1929年1月筹备，1930年1月成立于南京

为符合《国立中央研究院组织法》，自然历史博物馆于1934年7月1日更名为“动植物研究所”

1944年5月分立动物研究所、植物研究所

 中央研究院心理研究所于1928年11月决定设立，1929年1月筹备，1929年5月正式成立，在北平

中央研究院数学研究所于1941年筹备，1947年正式成立，在上海

医学研究所于1944年筹备，初设重庆国立上海医学院内

抗战胜利后，医学研究所筹备处迁到上海

 近代物理（即原子能）研究所于1945年秋筹设，嗣因仓促迁台，未能完成

1945年9月，中央研究院部分研究所迁沪，并接办日本政府所设立的上海自然科学研究所（1931年4月成立）

 1948年11月起，中央研究院部分人员设备迁往上海、广州和台湾

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