自然资源部第一海洋研究所学科建设截至2018年9月，自然资源部第一海洋研究所有学术学位授权一级学科硕士点6个，此外还设有博士后工作站
同时，与中国海洋大学、中国科学院大学、南京大学、山东科技大学、山东大学等多家高校及科研院所联合培养硕士/博士研究生，并与包括北京大学、清华大学等24所中国国内知名高校共建
学术学位授权一级学科硕士点（6个）：物理海洋学、海洋化学、海洋生物学、海洋地质、环境科学、环境工程 博士后科研工作站 （1个）：自然资源部第一海洋研究所博士后科研工作站
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