中国水产科学研究院机构概览据2019年5月中国水产科学研究院官网显示，中国水产科学研究院拥有有海区研究所3个、流域研究所4个、专业研究所2个、增殖实验站4个及院部共14个单位，与地方共建了5个研究机构
海区研究所：中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国水产科学研究院东海水产研究所、中国水产科学研究院南海水产研究所 流域研究所：中国水产科学研究院黑龙江水产研究所、中国水产科学研究院长江水产研究所、中国水产科学研究院珠江水产研究所、中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 专业研究所：中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所、中国水产科学研究院渔业工程研究所 院部机构：办公室、机关党委、人事处、人才工作处（研究生处）、学科与平台处、科研处、基建条件处、财务处、国际合作处、成果转化处、离退休工作处、监察与审计处
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