上海航天技术研究院研究部门据2018年5月上海航天技术研究院官网显示，研究院拥有国防科技重点实验室1家，国防科技工业技术研究应用中心1家，国家企业技术中心1家，上海市重点实验室4家，集团公司专业研发中心4家，省部级工程中心和企业技术中心15家以及16个院级研发中心；设有3家总体单位、3家总装单位、6家专业所；下辖23家企事业单位，形成了以上海闵行航天城、东川园区、松江园区、浦江园区“一城三区”，和浙江湖州、安徽广德、内蒙古呼和浩特三个型号研制试验和产业发展基地为核心的发展格局

 国防科技重点实验室：电磁环境国家级重点实验室国防科技工业技术研究应用中心：国家半导体照明应用系统工程技术研究中心电磁兼容分中心上海市重点实验室：上海市航空航天器电磁环境效应重点实验室等集团公司专业研发中心：集团公司精确探测研发中心等省部级工程中心和企业技术中心：上海市目标识别与环境感知工程技术研发中心等院级研发中心：八院激光探测研发中心等总体总装单位：导弹总体设计部（八部）、火箭总体设计所（805所）、卫星总体设计所（509所）、机载武器总体部（挂靠八部）、空间科学总体部（挂靠805所）、导弹总装所（800所）、火箭总装厂（149厂）、卫星总装所（812所）核心专业所：制导专业所（802所）、控制专业所（803所）、电子专业所（804所）、动力专业所（806所）、基础专业所（808所）、电源专业所（811所） 

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