北京交通大学交通运输学院院系专业学院现设有运输管理工程系、交通工程系、交通信息管理工程系、城市轨道交通系、物流工程系5个系，开设交通运输（含铁道运输、城市轨道交通、智能运输工程、高速铁路客运组织与服务、民航运输五个方向）、交通工程、物流工程、电子商务4个本科专业
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