济宁医学院基础医学院学术研究学院有山东省“十二五”重点学科2个，山东省“十二五”高校重点实验室1个和校级“十二五”重点学科1个
近三年承担上级科研项目57项，其中国家级科研项目14项，省部级科研项目16项；获得上级科研奖励10项；在国内外学术期刊发表学术论文219篇，SCI、EI收录论文46篇；出版著作教材38部
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