中国原子能科学研究院院旗中国原子能科学研究院院旗以红色为基本色，居中为院徽标识，院徽为黄色，院徽下为一道蓝色横条，旗杆套为白色
院旗的形状、颜色两面相同
院旗为长方形，其长与高为三与二之比
院旗以红色为背景，代表中国原子能科学研究院所从事国防科技事业以及中国原子能科学研究院事业的兴旺发达；蓝色既是和平、环保、核能和平利用的象征，又是海洋的颜色，它与居中的院徽组合在一起，寓意中国原子能科学研究院的事业像一艘扬帆的大船，在科技的海洋里，在市场经济的浪潮中，乘风破浪，勇往直前
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