中国农学会学术期刊据2017年11月学会官网显示，学会拥有《中国农学通报》、《农学学报》、《棉花学报》、《农业科研经济管理》、《植物遗传资源学报》、《食用菌学报》等学术期刊

 《中国农学通报》《中国农学通报》是中国农学会主办，是中国科学引文数据库（CSCD2012年版）收录期刊、中文核心期刊（2008版）、中国科技核心期刊、中国科协优秀学术期刊、全国优秀农业期刊，被中国核心期刊（遴选）数据库、中国农业科技文献数据库、中国农林文献数据库、联合国粮农组织数据库、国际农业和生物学文献数据库、维普中文期刊数据库等收录，并向海外10多个国家的有关数据库和图书馆赠阅；是《中国学术期刊文摘》和中国学术期刊综合评价数据库来源期刊

 《农学学报》《农学学报》2012年被中国科学技术协会授权使用“中国科协精品科技期刊”名称与标志，2014年被评为“中国科技核心期刊”（中国科技论文统计源期刊），被中国知网、中国学术期刊（光盘版）、万方数据库、维普全文收录

 《棉花学报》《棉花学报》（双月刊）1989年创刊，被国家新闻出版总署收录，被维普网、万方数据库、知网数据库、农业与生物科学研究中心文摘、日本科学技术振兴机构中国文献数据库收录，1992-2011年连续6届入选中文核心期刊，是中国科技论文统计源期刊（中国科技核心期刊）、CSCD中国科学引文数据库来源期刊（2013-2014年度）（含扩展版）

 《植物遗传资源学报》《植物遗传资源学报》是全国中文核心期刊，被中文科技期刊数据库、中国科学技术信息研究所、万方数据-数字化期刊群、中国核心期刊（遴选）数据库、《中国生物学文摘》、中国生物学文献数据库、中国学术期刊文摘（中文版）收录，入选中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊

被中国科学院文献情报中心、中国科学引文数据库收录为中国科学引文数据库（CSCD）核心期刊；被中国科学技术信息研究所收录为中国科技核心期刊（中国科技论文统计源期刊）

 《食用菌学报》《食用菌学报》是中文核心期刊，被收录为中国科技核心期刊、CSCD核心期刊，被《中国学术期刊综合评价数据库》、《中国期刊全文数据库》、《万方数据库》、《中国生物学文摘》、《龙源期刊网》、《Airiti Library华艺线上图书馆》、《中国科技期刊数据库》等多家数据库收录；2008年起，摘要被世界上最权威的农业、林业文摘数据库之一《CABI数据库》、美国EBSCO数据库收录

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