植物分类学报影响因子据2020年7月29日中国知网显示，《植物分类学报》总被下载249852次、总被引21100次，（2019版）复合影响因子为0.878、（2019版）综合影响因子为0.786
据2020年7月29日万方数据知识服务平台显示，《植物分类学报》被引量为15870次、下载量为58630次；据2018年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《植物分类学报》影响因子为0.75，在全部统计源期刊（6719种）中排第2511名
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