蚌埠医学院学报影响因子据2020年5月11日中国知网显示，《蚌埠医学院学报》总被下载736470次、总被引38272次，（2019版）复合影响因子为0.665、（2019版）综合影响因子为0.560
据2020年5月11日万方数据知识服务平台显示，《蚌埠医学院学报》被引量为35294次、下载量为331196次；据2017年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《蚌埠医学院学报》影响因子为1.42，在全部统计源期刊（6670种）中排第729名
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