生物工程学报影响因子据2018年3月中国知网显示，《生物工程学报》总下载1143314次、总被引54361次、（2017版）复合影响因子为0.977、（2017版）综合影响因子为0.587
《生物工程学报》在国内的评价指标评价机构：中国学术期刊（光盘版）电子杂志社、中国科学文献计量评价研究中心年 份总被引频次载文量基金论文比他引总引比影响因子20061970.78200713752380.870.940.799200814114420.830.940.917200913923620.830.920.874201014652260.860.891.070201115222300.900.911.14520121790.940.901.12320132310.920.961.17620140.970.931.071
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