生态学报荣誉表彰2000年，获中国科学院优秀科技期刊一等奖
2002年，获中国科协“第三届优秀科技期刊二等奖”
2002年，获“第二届国家期刊奖百种重点科技期刊”
2004年，获“第三届国家期刊提名奖”
2001—2014年，连续14届获CSPTCD“中国百种杰出学术期刊”
2006—2014年，获“中国科协精品科技期刊”
2008年，获科技部“中国精品科技期刊”
连年获得中国科学院科学出版基金资助期刊
2009年，获“新中国60年有影响力期刊”
2012—2015年，获“中国最具国际影响力学术期刊
2015年，入选中国科协“精品科技期刊Top50”项目
2015年，获“2015期刊数字影响力100强”称号
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