中国生态农业学报栏目方向《中国生态农业学报》设有农业生态系统与调控、作物栽培与生理生态、农业资源与环境、农业生态经济与生态农业等4个栏目
学报主要刊登农业生态系统结构功能、能量物质循环、演替及稳定性，农业高效耕作与栽培技术与机理、作物生理生态、作物分子生态，农业资源及其高效利用，农业环境保护与污染治理，农田有害生物群落特征及生态效应与农业病虫草害的生物防治，农业生态经济系统特征、评价与管理，生态农业模式与效益、农业生态工程技术、无公害农产品生产技术及农业可持续发展等方面的研究报告、研究简报及综述等
学报主要读者对象是从事农业生态学、生态学、生态经济学及农业环境保护等领域科技人员、高等院校有关专业师生，农业及环境管理工作者和从事生态农业建设的技术人员
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