中国生物医学工程学报影响因子据2018年5月11日中国知网显示，《中国生物医学工程学报》共出版文献3328篇，总被下载462286次、总被引25498次、（2017版）复合影响因子为0.759、（2017版）综合影响因子为0.519
据2018年5月7日万方数据知识服务平台显示，《中国生物医学工程学报》载文量为2422，被引量为16267，下载量为121067，据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《中国生物医学工程学报》影响因子为0.61，在全部统计源期刊（6230种）中排第2032名基础医学（75种）中排第34名
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