江苏省微生物学会下设机构学会现设十个专业委员会：医学微生物专业委员舍、兽医微生物专业委员会、工业微生物专业委员会、农业微生物专业委员会、食品微生物专业委员会、环境微生物专业委员会、微生物检验与检疫专业委员会、病毒专业委员会、自然疫原微生物专业委员会、基础微生物专业委员会
另设有学术委员会、组织工作委员会、科普宣传工作委员会和教学工作委员会
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